25 вересня 2019 адвокат Ріфат Яхін повідомив, що стан Джеміля Гафарова критичний. У березні 2019 він подав клопотання про медичний огляд Джеміля Гафарова через хворобу серця і нирок, щоб лікарі його обстежили і прийшли до висновку про наявність хвороб, які перешкоджають утриманню в СІЗО. У червні медобстеження провели, але тільки на захворювання серця. Це при тому, що у Гафарова хронічне захворювання нирок четвертого ступеня. В результаті лікарі видали висновок, що у нього немає захворювань, що перешкоджають утриманню під вартою», – розповів адвокат.
Адвокат через суд змусив лікарів провести повторне обстеження, його провели, але теж з порушеннями і неякісно. Під час обстеження в лікарні конвоїри його прикували кайданками до ліжка, а лікарі до нього не підходили і проводили опитування на відстані. Після обстеження дійшли висновку, що він може утримуватися у СІЗО.
У вересні 2019 Гафаров повідомив адвокату, що у нього опухли ноги і проявилася подагра. При цьому співробітники СІЗО ліки йому передавали вибірково.