Этап Гафарова из СИЗО Симферополя в Ростов-на-Дону проходил в конце января 2021 года и длился 11 дней, 10 из которых он провел в Краснодаре. Джемилю Гафарову было тяжело переносить переезды из-за инвалидности и сумок, после этапа находится в СИЗО №5 Ростова-на-Дону. Кроме того, Гафаров написал многочисленные заявления начальнику СИЗО о необходимости обеспечения его лекарствами и медицинской помощи.
19 февраля 2021 года судья Апелляционного военного суда РФ Теплюк Дмитрий Владимирович оставил в силе решение судьи Южного окружного военного суда Машукова Тимура Хасабовича о продлении содержания под стражей.
По состоянию на 5 февраля 2021 года находился в СИЗО-5 Ростова-на-Дону.
15 марта 2021 года "Крым.Реалии" сообщили, что состояние здоровья Гафарова ухудшается, но ему не оказывается медицинская помощь. Адвокат Рифат Яхин направил заявление о предоставлении медицинской помощи в СИЗО №5 Ростова-на-Дону, где сейчас находится заключенный.
19 марта 2021 года Верховный суд Крыма оставил в силе решение Железнодорожного районного суда Симферополя о том, что медсанчасть и крымское подразделение ФСИН незаконно уклонялись от предоставления информации о состоянии здоровья Джемиля Гафарова
13 апреля 2021 года начальник федерального казенного учреждения здравоохранения «Медико-санитарная часть №61 ФСИН России Пачганов А. С. отказался предоставлять адвокату информацию о состоянии здоровья Джемиля Гафарова. . Также в ответе указано, что Гафаров находится под контролем в этом лечебном учреждении с 29 марта 2019 года.
